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近年来，因玉米杂交种子质量问题，纠纷不断，导致市场混乱。据全国农业种子总站1993年以来对北方各大制种单位的抽检结果显示:杂交玉米种子合格率尽管连续多年呈上升趋势，但仍低于其它生产资料合格率，尤其是衡量种子质量的主要指标—种子纯度过于偏低。种子纯度的高低，直接影响着作物的产量。大量试验结果证明:玉米杂交二级种较一级种减产5%一8%，等外种较一级种减产15%以上。
一、玉米杂交种子纯度低的原因分析当前种子纯度偏低的主要原因，主要包括3种情况:
(一)亲本纯度低
亲本不纯、底子不清、来源渠道混乱，是造成种子纯度下降的最直接原因。近几年来，玉米制种面积迅速扩大，亲本数量不足和质量低劣的问题日趋突出。骨干自交系连续使用，混杂退化严重，甚至出现过父本再利用现象。另外，随着种子部门以及农业科研机构等制种单位增多，造成亲本来源多、乱、杂，其中很多自交系既无生产标准，也没有技术操作规程，技术资料不详，特征特性不清。还有一些部门，将性状不稳定的自交系推出，形成自交系种出多门、同名异源恶性循环现象，使亲本生产管理混乱，让种子生产单位真伪难辨，无可适从。
(二)良种繁育体系不健全
目前，我国农村全部实行了家庭联产承包责任制，过去“省提、地繁、县制”的良繁体制已经解体，新的良繁体制还不健全。一家一户的种子生产形式给统一管理带来很大困难，致使制种技术操作规程难以落实。如在隔离区的安排上不能严格按规定进行，出现无隔离或插花田，尽管种子生产单位花很大力气协调，但终因利益冲突，经常导致制种户与分制种户、种子生产单位与制种户发生纠纷。
(三)种子生产基地问题突出主要表现在:一是土地相对分散。土地承包的一个现实问题就是土地经营相对分散，给种子生产和管理带来诸多不便。尤其是劳力不足的农户，在母本去雄期更是“抽了东头地，漏了西头地”。二是基地农民质量意识差、思想素质低。在种子生产的各个关键环节上，他们往往不愿接受技术人员的指导，有的竟将制种技术措施擅自更改。从主观意识上讲，他们尚不理解“纯度”的真正含义，考虑的只是秋天把种子卖出去赚到钱。
二、提高种子纯度的有效途径
提高玉米杂交种子纯度的途径很多，根据种子生产周期，关键应采取以下几条措施:
(一)严格自交系管理
首先要把好品种审定关，对遗传性状不稳定的自交系坚决不准推出，未经审定的亲本一律不允许繁殖。其次，育种单位要下决心抓好自交系的提纯保纯工作，随时向种子部门提供高纯度的基础种子。作为种子部门，要在统一繁殖计划的基础上严格引种标准，杜绝盲目、私自引种。
(二)建立严格的繁殖控制体系
要根据新的种子经营机制，不断适应制种产业化发展需要，省种子站要重点抓好亲本的提纯繁殖，根据品种布局和更新更换要求，制定方案，统一计划、统一繁殖、统一管理、统一协调，并依托实力雄厚、技术力量强的集团公司或重点地、市提纯繁殖亲本。凡是繁殖亲本一定要摸清来源，严格审查有关资料和证件，同时要特别注意基础种子的引进选用。
(三)要严格执行自交系保纯繁殖技术操作规程
亲本繁殖单位要每年坚持种植一定面积的穗行鉴定圃，经严格选株套袋后，第二年按需种子数量进行原种穗行繁殖，再经严格行选，使穗行混合脱粒，供统繁原种使用。在整个繁殖过程中，必须严格隔离〔穗行1000m以上，原种500m以上)，并抓好去杂去劣、收获、脱粒、贮藏等技术环节，切实落实制种关键措施。保证种子纯度的环节很多，当前应重点从内部入手，加强技术培训，制定奖罚制度。技术培训要分层次(公司蹲点技术人员、基地技术人员、制种农户等)，提高技术人员、制种农户对“纯度”的真正认识。层层建立承包责任制，分层次签订合同，依据目标要求(单交一级种纯度98%以上，田间杂株率父本不高于0.2%，母本不高于0.4%，母本散粉株率不高于0.4%)定报酬、定奖罚，充分调动专业人员对保证种子纯度的积极性及责任心。要推广先进的制种技术措施，组织专业队伍统一去杂去雄，分期去杂，含苞带叶去雄，父本散粉结束后割除父本行，改收籽粒为收果穗等措施。要严格建立田检档案，包括技术员在内组织好专业队伍，在花期对需去杂去雄的田块，进行定期、不定点田检，对检查结果如实建立档案。花期后，进行统计，做到田间质量心中有数，对达不到种子要求的田块坚决予以报废，决不能吝惜迁就。
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