一是要定期测量种子水分为确保入库种子达到安全含水量，禾谷类作物种子安全含水量为12％~15％，油料作物种子安全含水量为8％~10％，薯类作物安全含水量为65％~80％。在冬贮过程中，种子水分随环境温度和湿度的变化而变化，所以要定期测定种子水分，以防坏种。

二是要定期测定种子发芽率要根据种子库存的实际情况，定期、定点、定层抽取种子样品进行发芽试验，特别是在种子入库前和出库前必须做发芽试验，以确保种子质量。

三是要经常检查种子病虫鼠害要经常做好种子病虫鼠害检查，一旦发现要立即采取有效措施，如喷施药剂和清洗加工等方法，尽快清除病虫鼠害。

四是谨防突然变化温度在贮藏种子过程中，一般在室外贮藏的种子不能突然转到室内，同样，在室内贮藏的种子也不能突然转到室外，否则温度的突然变化会大大降低种子的发芽率。

五是要注意忌与农药、化肥混合贮藏忌用塑料袋装种子;忌烟气熏蒸;忌种子与地面直接接触等。